A seguito di una richiesta della Associazione Tennistavolo Croata, il Comitato Esecutivo della European Table Tennis Union ha deciso che i Campionati Europei Giovanili 2021 si giocheranno all'Arena Varaždin nella città di Varaždin, che è già stata sede della rassegna continentale Under 21 del 2020.

Per garantire il mantenimento delle linee guida per la tutela della salute e della sicurezza di tutti i partecipanti, quest'anno i Campionati saranno suddivisi in due tornei, ciascuno della durata di 7 giorni. Dal 18 al 24 luglio giocheranno gli Under 19 e del 26 luglio all’1 agosto gli Under 15.

Come risultato della ripartizione dell'evento in due, il Comitato Esecutivo di ETTU ha accettato di rinunciare al consueto supporto del 50% per l'ospitalità, per compensare l'Associazione ospitante per qualsiasi potenziale riduzione delle entrate causata dalla nuova formula.